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Vɪɴɪᴄɪᴜꜱ

@f.vinicii

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קדש ליהוה
“Lying in the gutter, aiming for the moon.”
📓 Physical Chemistry, MSc.
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📷: iPhone SE. by @f.vinicii

MECHANISTIC INSIGHTS INTO THE NONCOVALENT INHIBITION OF SARS-COV-2 PLPRO: A MULTISCALE COMPUTATIONAL STUDY

Nesta semana foi publicado no Journal of Computer-Aided Molecular Design (JCAMD) um estudo bastante interessante, resultado do nosso mestrado, no qual empregamos ferramentas computacionais — docking molecular e Dinâmica Molecular — para desvendar o comportamento estrutural da PLpro (Protease Semelhante à Papaína, em tradução livre) do SARS-CoV-2.

Essa “senhora”, nada boazinha, não apenas auxilia na replicação do vírus, como também contribui para o enfraquecimento das respostas imunológicas do hospedeiro, desencadeando inflamações graves. Por isso, está fortemente associada aos estágios mais severos da COVID-19 e à sua letalidade.

Um ponto particularmente interessante do estudo foi a identificação de uma região descrita na literatura como bastante curiosa, composta por resíduos de aminoácidos altamente flexíveis — a BL2 loop — que funciona como um verdadeiro “portão molecular” para a entrada do substrato na tríade catalítica, onde a PLpro exerce sua função.

Nossas simulações nos permitiram compreender como interações não covalentes desempenham um papel fundamental no bloqueio desse portão por meio de inibidores naftalênicos, impedindo a passagem do substrato e, consequentemente, inibindo a atividade da PLpro.

Todo o estudo foi conduzido empregando uma robusta análise estatística multivariada e termodinâmica clássica (PCA e FEL), combinadas com cálculos de energia livre (SIE e MM/GBSA), contribuindo para o desenvolvimento de uma nova geração de fármacos baseados em inibição não covalente contra a COVID-19 e outras viroses.

Obrigado a todos os envolvidos! Em especial ao Prof. Dr. José Rogério de A. Silva (UFPA), ao Prof. Dr. Renan Valente (UFPA) e a Prof. Dra. Jéssica Araújo (Unicamp), bem como ao CompMBio e ao CCAD-IA UFPA.

<3

📄: https://link.springer.com/article/10.1007/s10822-026-00763-z

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P.S. As fotinhas que seguem contam um pouco dos bastidores desse paper, desde o início (lá por 2022) até a publicação final (última segunda). Coisas boas a ciência nos faz haha. by @f.vinicii

14/03: It’s so biutyfullllll

Posso dizer que zerei a vida duas vezes, para cada show do Coldplay que fui (a banda que escuto desde os 8 anos, no caminho pra escola). Agradeço a D’us por isso, e seguimos vivendo uma vida para se lembrar. Obg tb a @lustefanny que sempre embarca nas minhas insanidades, o que, sem dúvida, deixou esse momento ainda mais mágico.

Thanks for the amazing and surreal song c, j, w, g and p. You’re really one big band.
#coldplaysaopaulo
@coldplay
@coldplaybrasil

Believe in Love 💜 by @f.vinicii

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#Heisenberg2027 #ConcursoDeBolsas #ProcessoSeletivo #MatemáticaECiênciasDaNatureza #ENEM by @f.vinicii

Quero ser mandado, adorado, acariciado, machucado e amado por você. E depois, pode me mandar embora , mesmo que sejam quatro horas da manhã. by @f.vinicii

Meu “último” post dessa campanha. A partir de agora, continuaremos a luta nas salas de aula, no laboratório, na ciência e na resistência. A estrela brilhou e nós vamos sorrir! ⭐️. by @f.vinicii

Sobre uma resistência ⭐️ by @f.vinicii

Vamos que vamos 💪🏻🇧🇷⭐️ by @f.vinicii

Bora Lula ⭐️

#boralula
#overdeeoamareloénosso 🇧🇷 by @f.vinicii

Um raro carrossel formado, majoritariamente, por mim. É que existir é coisa de doido, caso de loucura. Existir não é lógico. by @f.vinicii

We are the kings and queen of promise. by @f.vinicii

O pavê de cupuaçu ganhou meu coração em 2004. by @f.vinicii